基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
多组学联合分析>
分子育种>
动植物基因组测序>
UMI small RNA测序—精准定量small RNA表达水平,探究其功能及调控机制
UMI small RNA测序,文库构建时引入特异性分子标签(UMI),结合高通量测序进行精准定量,研究某物种某组织在特定条件状态下18-30 nt的small RNA片段序列信息,主要应用在动植物生长发育调控研究、抗病抗逆调控研究、生物性状及突变调控研究等;在疾病研究方面,可研究疾病发生调控机制、寻找生物标记、靶向药物研究等。 尊龙凯时UMI small RNA测序采用Illumina测序平台,通过建库引入特异性分子标签,实现精准定量,通过与数据库比对, 可实现small RNA序列的鉴定、靶基因分析和功能分析, 以及包含miRNA、siRNA、piRNA等多种small RNA类型的分析研究需求等。精准:
UMI small RNA 是在建库过程中,利用长度一定、序列随机 / 固定的分子标签来标记初始cDNA 分子,之后进行 small RNA 的测序分析,测序后利用 UMI 标签追溯每一个片段的来源,实现更加精准的定量。应用方向
适用于所有普通small RNA建库的替换。植物方向
植物对环境的适应性、突变、个体发育、遗传性状动物方向
农艺性状、适应性、个体发育、遗传性状、药物干预模式动物调控机制真菌方向
机理性、应用性、药用食用性研究尊龙凯时优势
1. 周期快、质量好,稳定性高
UMI small RNA通过先进的测序平台,一次性可获得数百万条序列,结合先进的分析方法,可在全基因组水平快速鉴定和预测各种类型的small RNA,得到与调控相关的所有基因。项目周期40天
测序平台Novaseq
2. 方案设计专业,质控严格
尊龙凯时small RNA(sRNA)测序采用Illumina测序平台,可针对样本中的miRNA、siRNA、piRNA展开分析,既能鉴定已知sRNA、也能预测新的sRNA并预测sRNA的靶基因,为研究small RNA功能及调控机制提供有力手段。材料选取
RNA样品
>200ng
文库构建
UMI small RNA文库
PE150测序
信息分析
3. 项目文章以及物种经验丰富
尊龙凯时已经成功对人,小鼠,鸡,酵母,烟草,拟南芥,榆树,油菜,褐飞虱等多个物种进行UMI small RNA测序分析,项目经验十分丰富。80人
分析团队7年
项目经验600+
结题项目1对1
项目服务信息分析
尊龙凯时UMI small RNA测序是在建库的时候用包含UMI标签的接头替代普通建库的接头,在测序后可以通过对UMI标签的识别准确去除扩增产生的重复对基因进行准确定量,进一步能够解析miRNA、 siRNA、piRNA和其它非编码RNA以及相应靶序列。测序原始数据质控后,进行Clean reads 长度分布统计,small RNA注释,已知 miRNA 注释,ncRNA分析,新miRNA 预测(有参考基因组),差异基因分析,miRNA 家族分析,差异表达 miRNA聚类分析,miRNA靶基因预测,靶基因GO、KEGG富集分析。通过数据分析,协助研究者快速从海量数据中找出与条件相关的small RNA,然后进?步探究这些small RNA的生物学意义。关联分析
1.miRNA与lncRNA关联分析
2.miRNA与mRNA关联分析
3.miRNA与CircRNA关联分析
送样建议
样品类型 | 送样量 |
---|---|
新鲜植物组织 | ≥150mg |
新鲜动物组织 | ≥100mg |
新鲜培养细胞 | ≥1×10 6 |
菌体 | ≥1×10 6或≥100mg |
新采集的全血 | ≥3 ml |
Total RNA建库起始量 | ≥200ng |
常见问题
1.UMI小 RNA 测序对样品提取有什么特殊要求?
2.为什么实验结果中会存在降解的 rRNA序列?
3.进行UMI small RNA 测序时,客户除了样品以外还需要提供哪些相关信息?
更多内容,可扫描侧边栏"一对一业务咨询"二维码添加科研服务经理咨询。
售后服务可联系侧边栏"在线客服"、电话400-6581585,或发送邮件至 service@novogene.com
Copyright@2011-2024 All Rights Reserved 版权所有:尊龙凯时 京ICP备15007085号-1