基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
多组学联合分析>
分子育种>
动植物基因组测序>
表观遗传多组学
DNA甲基化+转录组(RNA-seq)
联合转录组(RNA-seq),可以了解样本中DNA甲基化修饰和RNA表达是否存在整体上的相关性、样本中哪些基因的转录表达受到DNA甲基化修饰的影响的基因及功能。RNA甲基化(m6A修饰)+转录组(RNA-seq)
在进行m6A相关研究时结合转录组(RNA-seq),进一步挖掘RNA甲基化酶靶基因,探究转录本修饰水平与基因表达水平的相关性。染色质微环境多组学
ATAC-seq+转录组(RNA-seq)
将ATAC与转录组(RNA-seq)关联分析,可以研究ATAC信号反映的染色质开放性程度与基因表达调控的机制,评估用染色质开放性阐述转录水平乃 至下游表型变化的可信度。CUT&Tag+ATAC-seq+转录组(RNA-seq)
CUT&Tag与ATAC-seq以及转录组(RNA-seq)联合分析,可以探究组蛋白标记调控和染色质开放性的一致相关性,探究转录因子调控转录起始的过程,以及完善染色质微环境调控基因表达的调控网络。Hi-C+转录组(RNA-seq)
整合Hi-C与转录组(RNA-seq)数据,用以研究染色体结构变化与基因表达调控之间的关系,从基因组、转录组两种组学结合的视角阐述生物体性状形成的相关机制。染色质微环境多组学
一对一项目服务,科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务,确保每一个环节都能出色完成,同时还搭建各组学联合分析流程,全面助力客户科学研究及发表文章进军高分文章。多组学送样建议
DNA甲基化 | 取样标准 | 表观遗传学具有显著的组织特异性,不同组织细胞间甲基化状态可能会有巨大差异,重点需要参考老师的研究课题进行取样 |
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测序深度 | 全基因组甲基化测序,测序深度建议 30×/ 样 | |
RNA甲基化 (m6A修饰 ) | 取样标准 | 取样时间、部位、环境等尽量保持一致,不同类型的样本可能会存在一定差异,针对具体研究部位进行取样 |
ATAC-seq | 取样标准 | 取样过程中,尽可能减少人为造成的样品间差异,且确保自己的样本没有外源污染 |
CUT&Tag/ChIP-seq | 取样标准 | 采集的样本应该通过严格的细胞学、组织学、病理学等相关鉴定,且确保自己的样本没有外源污染 |
Hi-C | 取样标准 | 微小个体生物,建议选择相对近源的物种进行混样,混样个体切忌太多;含水量极高的样本,建议客户多准备一些样本,选择底部细胞沉淀进行实验;辅助组装样本尽可能保持与基因组样本来自同 一个体 ( 或相对近源的个体 ) |
注:各组学样本分装保存并寄送 |
信息分析内容 ( 单组学 )
DNA甲基化 | RNA甲基化 | ATAC-seq | CUT&Tag/ChIP-seq | Hi-C |
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甲基化位点检测 | 结合位点检测(peak calling) | 互作图谱构建 | ||
单样本甲基化分析 | Motif分析 | 差异互作图谱分析 | ||
功能区域甲基化水平分布 | 基因功能区peak分布 | A/B compartments分析 | ||
差异甲基化区域分析 | 差异分析 | TAD分析 |
信息分析内容 ( 多组学 )
DNA甲基化 | RNA甲基化(m6A 修饰 ) | ATAC-seq | CUT&Tag/ChIP-seq | Hi-C |
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与RNA-seq联合分析 | ||||
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