基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
多组学联合分析>
分子育种>
动植物基因组测序>
circRNA测序—研究circRNA的差异表达如何影响生物学过程
环状RNA(circular RNA, circRNA)是一类特殊的非编码RNA分析,测序采用Illumina测序平台进行测序,针对有参考基因组样本开展准确的circRNA鉴定以及来源基因的分析, 环状RNA测序在医学、农学研究领域应用越来越广泛。高效:定量准确、检出率高:
基于高通量测序,依据主流数据库和circRNA鉴定软件,分析项目物种的circRNA信息,深入挖掘circRNA在转录调控中所发挥的重要功能。应用方向
circRNA测序适合生命体生长发育等各个阶段、部位或方面的研究。生长发育
人、小鼠、果蝇等细胞、组织生长发育研究。癌症疾病
肿瘤、代谢病、免疫病等疾病发生与诊治研究。植物
植物胁迫、生长发育、遗传育种等研究。尊龙凯时优势
1. 平台优,周期短,性价比高
尊龙凯时circRNA测序采用先进的Illumina平台测序,并与高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)结合,实现快速、稳定的测序数据分析及交付。交付周期<60天
测序平台Novaseq
2. 方案设计专业,质控严格
尊龙凯时circRNA测序采用去核糖体及线性RNA方式进行建库,能够有效捕获样品中circRNA,满足同时circRNA差异表达水平的分析以及miRNA结合位点分析。从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都经过科学 、缜密的设计,以保障高质量研究成果。材料选取
提取RNA
≥ 2 μg
文库构建
链特异性文库
PE150测序
8Gb
信息分析
3. 项目文章以及物种经验丰富
尊龙凯时已经成功完成对人,鼠,猪,绵羊,耗牛,牛,鸡、兔子,树鼩,鸟类,鸡,斑马鱼,罗非鱼,草鱼,牙鲆,水稻,烟草,棉花,梅花,陆地棉,二穗短尾草,西瓜,梨,海带,杜仲,真菌、葡萄等等, 近百个物种进行circRNA测序分析,助力客户在Molecular Therapy等权威杂志发表多篇高水平文章。80人
分析团队7年
项目经验400+
结题项目1对1
项目服务信息分析
尊龙凯时circRNA测序项目,标准分析流程:主要包括质控,比对,拼接,鉴定,筛选,定量,差异分析,富集分析,miRNA结合位点分析,组织特异性分析,编码潜能预测等等环节。该分析的核心是circRNA 可以通过与 miRNA 结合的方式抑制 miRNA 的功能。因此,对鉴定的 circRNA进行 miRNA 结合位点分析,有助于进一步研究 circRNA 的功能。关联分析
1.circRNA与miRNA关联分析
2.circRNA、miRNA与mRNA关联分析
送样建议
样品类型 | 送样建议 | 备注 |
---|---|---|
新鲜动物组织干重 |
内脏组织、脑组织≥?0.5g脂肪、皮肤、骨头、血管等其他组织≥2g |
核酸不丰富部位, 例如脂肪、成熟皮肤、骨头等部位建议酌情增加送样量 |
新鲜植物组织干重 |
叶片、花 ≥0.8g,根、茎、种子等其他组织≥2 g |
成熟部位,例如植物茎、根、种子等部位建议酌情增加送样量 |
新鲜培养细胞 |
≥1X10 7个 | - |
BD采血管 |
≥2管 | 血液样本送样前加入EDTA抗凝管,推荐使用BD管送样 |
Total RNA建库起始量 |
总量:≥2ug | 浓度:≥50ng/uL;体积:20uL ≤ V ≤120uL |
常见问题
1.lncRNA 数据中有多少是circRNA 的数据?
2.lncRNA 建库方法的检出率为多大?
3.circRNA 的长度分布是多少?
4.miRNA结合位点分析具体指什么?
5.circRNA测序都可以和哪些数据联合分析?
6.为什么需要 8G 这么大的数据量?
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